Universitas Muhammadiyah Yogyakarta memiliki fasilitas dengan kualitas bintang lima yang sudah diakui oleh sebuah lembaga akreditasi Internasional terkemuka di bidang pendidikan tinggi yang berkantor di London, yakni Audit Eksternal Quacquarelli Symond (QS). Dengan begitu fasilitas yang tersedia di UMY sangat nyaman dan mendukung bagi proses belajar mengajar.